在2023年全國大學排行榜中，南方科技大學排名第一百八十八位。最好的學科為物理學、生物科學、化學等。
南方科技大學為國家高等教育綜合改革試驗校。以理、工、醫為主，兼具商科和特色人文社科，突出“創知、創新、創業的辦學理念和特色。截至2019年3月，南方科技大學已簽約引進教師800余人，在300余名教學科研序列教師中，包括院士26人（全職院士11人），國際會士32人，國家特聘專家64人，國家特聘專家（青年） 84人， 教育部“特聘專家” 20人，“國家特支計劃”專家8人。致力于培養具有“家國情懷、全球視野、綜合素養、創新能力”的拔尖創新人才。
在南方科技大學所有專業中，物理學專業推薦指數為5.0；生物科學專業推薦指數為4.9；化學專業推薦為4.9。
| 序列 | 專業名稱 | 推薦指數 |
| 1 | 物理學 | 5 |
| 2 | 計算機科學與技術 | 4.8 |
| 3 | 通信工程 | 4.8 |
| 4 | 金融工程 | 4.8 |
| 5 | 數學與應用數學 | 4.3 |
| 6 | 材料科學與工程 | 4.7 |
| 7 | 微電子科學與工程 | 4.6 |
| 8 | 金融數學 | 4.3 |
| 9 | 化學 | 4.9 |
| 10 | 生物信息學 | 4.9 |
| 11 | 光電信息科學與工程 | 4.7 |
| 12 | 金融學 | 4.8 |
| 13 | 生物醫學工程 | 4.9 |
| 14 | 生物技術 | 4.9 |
| 15 | 生物科學 | 4.9 |
| 16 | 信息工程 | 4.8 |
南方科技大學各專業的推薦指數結果僅代表學生對相關專業的推薦意見，不代表官方的專業排名，僅供參考
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